Hệ thống Aquarium của Bảo tàng Hải dương học hiện nay được bố trí trong một không gian diện tích 5000m2 với một quần thể bao gồm các hồ nuôi sinh vật biển thường xuyên nuôi hơn 300 loài sinh vật biển tiêu biểu và rất có giá trị (các loại Rùa biển, cá Mập, cá Đuối, cá Chình, cá Mú, san hô sống với các loại cá cảnh biển, tôm Hùm, …) phục vụ nghiên cứu, tham quan cũng như giáo dục cộng đồng.

   Mỗi năm Bảo tàng Hải dương học đón hàng trăm ngàn lượt khách du lịch trong nước và ngoài nước đến tham quan, nhiều nhà khoa học và sinh viên - học sinh đã đến nghiên cứu, học tập, .... Bảo Tàng hiện đang là nơi giới thiệu cho cộng đồng các tri thức về biển: khai thác, bảo vệ nguồn lợi-tài nguyên môi trường. Để từ đó có một cái nhìn đúng đắn về biển - Đây cũng là nơi khơi nguồn cảm hứng cho các nghệ nhân, và cùng với các nhà khoa học góp phần khám phá và phát triển tiềm năng phong phú của biển và đại dương.