Phòng Thông tin - Thư viện hiện có 3 cán bộ là Cử nhân.

Ban lãnh đạo

Hội đồng khoa học

Phòng Quản lý tổng hợp

Phòng Vật lý biển

Phòng Địa chất - Địa mạo biển

Phòng Sinh thái biển

Phòng Thủy - Địa hóa

Phòng Thực vật biển

Phòng Nguồn lợi thủy sinh

Phòng Động vật có xương sống biển

Phòng Công nghệ nuôi trồng

Phòng Hóa sinh biển

Phòng Sinh vật phù du

Trung tâm Dữ liệu và GIS - Viễn thám

Phòng Thông tin - Thư viện

Phòng Truyền thông và Giáo dục môi trường

Phòng Kỹ thuật nuôi sinh vật biển

Phòng quản lý, chế tác và trưng bày mẫu vật

Trạm quan trắc Nha Trang

Trạm quan trắc Cần Giờ

Trạm quan trắc và phân tích môi trường biển Miền Nam

Trung tâm Tư vấn, Ứng dụng và Chuyển giao khoa học, công nghệ biển