Được sự cho phép của Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam , Viện Hải dương học phối hợp với các bộ phận chức năng của Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam đã tổ chức Hội nghị quốc tế tổng kết giai đoạn I Chương trình khảo sát hỗn hợp Việt Nam – Philippine trên biển Đông (JOMSRE I-IV) tại thành phố Hạ Long từ ngày 26 đến ngày 28 tháng 3 năm 2008.

Từ ngày 28/1 đến 1/2/2008 Hội nghị khu vực về trọng tâm và hợp tác trong tương lai trong lĩnh vực nghiên cứu tảo gây hại (HABs) – Phiên họp GEOHAB Châu Á lần thứ 2 sẽ được tổ chức tại Viện Hải dương học, TP Nha Trang.

Ngày 28/12/2007, Viện Hải dương học đã long trọng tổ chức lễ đón nhận Huân chương Độc lập Hạng II. Đến dự lễ và chia sẻ niềm vinh dự của CBCC Viện Hải dương học có các đại diện Ban ngành ở trung ương và địa phương cũng như các cơ quan nghiên cứu khoa học, các trường đại học và các cơ quan đối tác của Viện HDH. Viện cũng đã nhận được nhiều lẵng hoa và điện chúc mừng từ các cơ quan trong nước.

Lúc 15 h ngày 14/9/2007, lễ kỷ niệm 85 năm thành lập Viện Hải dương học đã diễn ra tại Hội trường Viện Hải dương học. Đến dự lễ kỷ niệm gồm các đại diện của Viện Khoa học và Công nghệ Việt Nam, UBND tỉnh Khánh Hòa, các cơ quan trung ương, các Sở, Ban ngành của các địa phương ven biển, các cơ quan nghiên cứu khoa học trong và ngoài nước, trường Đại học, các cơ quan quốc tế, các cán bộ của Viện đã về hưu và toàn thể cán bộ viên chức của Viện.